Сам Меджугорье — небольшой и компактный город, поэтому четкого деления на районы нет, однако есть несколько локаций, которые стоит учитывать при выборе отеля. Основная часть гостиниц, апартаментов и гостевых домов расположена в центральной зоне рядом с церковью Святого Иакова и главной площадью. Это оптимальный вариант для паломников и туристов, желающих быть в эпицентре событий и иметь удобный доступ к основным достопримечательностям.
Для тех, кто предпочитает тишину и уединение, хорошими считаются жилые кварталы на окраинах города, где можно забронировать гостевые дома с уютными комнатами. Это подойдет семьям и парам, которые ценят спокойный отдых и возможность готовить самостоятельно, например, на базе апартаментов.